全院在职职工总数234人，其中高级专业技术职称103人（含研究员33人），中级专业技术职称83人。享受国务院政府特殊津贴人员18人，省级科技拔尖人才8人,山东省有突出贡献的中青年**4人，厅级科技拔尖人才19人。 院下设水资源与水环境研究所、农村水利研究所、水土保持与生态研究所、水工与材料结构研究所、岩土工程研究所、灌浆技术研究所、工程检测研究所、基础检测研究所、中心试验室、自动化研究所、水利科技信息研究所、勘察设计研究所、水利工程建设与管理研究所等13个业务部门。是山东省水利工程建设质量与安全检测中心站、山东省水利工程土工合成材料测试中心、山东省水利科技信息中心站(部级科技查新单位)、山东省现代农业节水工程技术中心、山东省灌溉试验中心站、山东省水利司法鉴定中心、山东省水土保持研究所、山东省水利发展研究所、山东省海咸水利用研究所、山东省水资源水环境重点试验室、山东省水利工程技术研究中心的技术依托(挂靠)单位。该院下属山东水利岩土工程公司、山东省科苑水利勘察设计咨询中心、山东省科源工程建设监理中心等院属科技企业。 该院具备的从业资质包括：建设监理、水利水电设备监造、水资源调查评价、建设项目水资源论证、建设项目水土保持方案编制、水土保持监测、大坝安全鉴定、水利司法鉴定、水利工程试验、土工试验、水利工程质量检测等11项甲级和工程咨询、工程施工、地质勘查、工程设计、工程勘察等5项乙级（二级）资质。
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